在校生は「生徒」ではなく「学生」という身分で、自主性・自立性を尊重して扱います。「学生」には責任ある行動が求められます。授業は２時間連続の90分授業です。授業間の休み時間は10分で、昼休みは50分です。2学期制で夏休みや春休みが長いのも特徴です。

日本は資源に乏しい島国ですから、モノやサービスを作って世界に売ることで日本経済は成り立っています。情報機械システム工学科ではこれらの工業製品や情報システムの生産方法、管理方法を学びます。そして、日本と世界をつなぐ物流の要が海運であり、この分野について学ぶのが商船学科です。こうした分野の即戦力になれる技術者を育てる学校だからこそ、多くの企業から必要とされています。

現在、多くの国公私立大学が3年次および2年次編入試験により、高専からの編入生を受け入れています。主として高専卒の学生を編入生として受け入れるために設立された大学として、豊橋技術科学大学や長岡技術科学大学があります。ほかの大学にも編入学が可能です。編入学には、推薦による入学と学力試験に合格しての入学の２通りの方法があります。編入学試験は大学によって時期が異なるので、高校を卒業して大学を受験するよりも受験の機会が多くなり、試験科目も少ないため、受験の負担が少なくなります。また、大学ではなく本校の専攻科に進学し、学士の学位を取得する方法もあります。

修了して学士の学位を取得すれば、四年制大学卒業と同等と見なされます。

平成20年にシンガポ－ルポリテクニックのマリタイムアカデミーと国際交流協定を結び、夏休みに学生交流と短期の語学研修（英語）をおこなっています。また、平成26年から、トルコのイスタンブル工科大学と国際インターンシップをおこなっています。他にも、約3週間のホームステイを行うプログラムがあります。また、1年間休学をして、アメリカやオーストラリアに私費で語学留学する学生もいます。

現在、マレーシア、インドネシア、モンゴル、ラオスから各1名の計4名が、本校で勉学に励んでいます。

また現在はなくなりましたが、電子機械工学科がM科、制御情報工学科がI科と呼ばれていました。

1年生から3年生までの低学年の間は制服での登校を義務づけています。4年生から5年生の高学年は、儀式の際には制服を着用しますが、ふだんは私服で過ごしています。

また、商船学科には卒業式と乗船実習の際に着用する白い制服が別にあります。男子は白の学生服、女子は白のブレザーにスカートです。

作文の課題については以下を参照してください。

https://koho.s.toba-cmt.ac.jp/wp/wp-content/uploads/suisenkako2023.pdf

また平成22年度より、高等学校就学支援金制度が始まり、入学より３６カ月（１～３年）については年額118,800円の助成があります（年収９１０万円以上の世帯は除く）。また、保護者の所得によっては、授業料全額が助成される場合もあります。本科４年生から専攻科２年生までについては授業料減免制度があります。

本校は攻玉社分校、鳥羽商船黌として明治14年（1881年）に創立されて以来、135年の長い伝統をもっていますが、工業系の学科として昭和60年に電子機械工学科、昭和63年に制御情報工学科を設置し、平成31年にそれらを統合し情報機械システム工学科を設立しました。これは他の工業高専と同じく工学について学ぶので、商船高専だからといって特別な実習はありません。

本校では1～3年生の間にこれら全ての分野の基礎を学習し、4年生以降1人1人が学びたい専門分野を選択して学習します。

志向性ユニットは「開発・設計」、「生産技術」、「顧客対応」、「ビジネス基礎」、「国際性」があります。

選択したユニットによって必修科目が変わるので学生の個性・特性に合ったものを選ぶことができます。

モバイルアプリケーションは、スマートフォンやタブレット端末による各種アプリケーションを開発できる技術者を育成します。

スマートセンシングは、身の回りにある情報を定量的に計測し、分析・可視化を行う技術者を育成します。

パワーエレクトロニクスは、住所や事務所向けの電力供給・管理システムの整備、保守を担う技術者を育成します。

エアロスペースは、航空宇宙産業の製造現場で活躍するため、生産現場の管理運営能力を持つ技術者を育成します。

ロボティクスは、生産を担うロボットの開発、設計、製作、制御、整備ができる技術者を育成します。

生産技術は、生産現場のとりまとめとして幅広く技術を理解し、各部門の要望をまとめる調整能力を培います。

顧客対応は、電気機器やビルシステムの導入・保守運用をするための顧客との交渉力を養います。

ビジネス基礎はビジネス的な視点を持つ技術者として活躍するために、経営・管理などを学びます。

国際性は、グローバルな視野を持ち、英語を中心とした語学力の向上を進めます。

航海コースは、航海士や船長を養成するコースです。将来、学生が貴重な人命と莫大な財産である船や高価な積荷を安全に、かつ経済的に目的地まで送り届ける重要な仕事を全うできるような教育を行っています。

機関コースは、機関士や機関長を養成するコースです。学生が主機関、補助機関、発電機やその他多くの種類の機械の運転や保守に精通する高度な技術や知識を身に着けられるような教育を行っています。

この実習では、他の商船高専の学生と一緒に実習することが多い他、文部科学省系の国立大学法人「東京海洋大学」、国立大学法人「神戸大学」、および国土交通省所管の海上技術学校、海上技術短期大学校、海技大学校の生徒、学生とも一緒に練習船に乗船して実習を受けることもあります。様々な教育機関の学生・生徒から見識を得ることができ学生の成長に大きく役立っています。

商船学科では卒業後は、大型外航船の士官になるために必要な海技士免許である三級海技士の筆記試験及び免許講習が免除されるので、口述試験と身体試験に合格すれば三級海技士免許上が得られます。在学中にはさらに上級の二級海技士、一級海技士の筆記試験を受けることができます。

また自転車通学は池の浦駅-学校間では、池の浦駅に駐輪場がないため不可となっています。

1年生から3年生までの間は制服での登校を義務づけています。4年生から5年生の高学年は、儀式の際には制服やスーツなどの正装を着用しますが、普段は私服で過ごしています。